Для изменения пароля пользователя VNC используйте утилиту vncpasswd. С документацией к ней можете ознакомиться по ссылке: https://linux.die.net/man/1/vncpasswd
ssh root@server IP su - vncuser vncpasswd
или
ssh vncuser@server IP vncpasswd
Или можете зайти на VPS по VNC и использовать команду vncpasswd в терминале.