Можно ли самостоятельно настроить firewall на VPS

Да, у вас будет такая возможность. Вы сможете изменять правила IP-tables, строя таким образом файервол. Либо можно установить специализированный пакет (например, CSF, о котором вы можете прочитать в статье Установка ConfigServer Security and Firewall), который автоматизирует этот процесс.